Dans l'après-midi du 24 juin 1981, Ivanka Ivankovic, alors âgée de 15 ans, et Mirjana Dragicevic, 16 ans, se promenaient au pied de la colline de Podbrdo lorsque, à quatre heures de l'après-midi, elles ont aperçu une silhouette féminine sur un petit nuage. Effrayées, les deux jeunes filles se sont enfuies et ont regagné le village. Peu après, vers 18 h 30, elles décident de retourner sur la colline en compagnie de Vicka Ivankovic, la cousine d'Ivanka. Les trois filles auraient revu la silhouette féminine avec un enfant dans les bras et l'auraient immédiatement identifiée à la Madone.
Le lendemain, les filles sont remontées sur la colline, accompagnées de Marja Pavlovic, cousine de Mirjana, de Jakov Colo, 10 ans, et d'Ivan Dragicevic, 16 ans. La Vierge serait apparue à nouveau à tout le groupe et aurait eu un bref dialogue avec Ivanka au sujet de sa mère, disparue quelques mois auparavant.
Le 26 juin, le groupe est remonté sur la colline et a de nouveau eu un bref dialogue avec la Vierge. La Vierge invite les voyants à prier pour la paix.
La nouvelle des apparitions commence à se répandre, suscitant l'irritation de la police yougoslave. Le 27 juin, on demande aux enfants de se soumettre à un examen psychiatrique, mais ils refusent.
Au coucher du soleil, ils auront un nouveau dialogue avec la Vierge. Sur le lieu précis des apparitions, les habitants du village placent une pierre marquée d'une croix blanche.
Le 28 juin, au moins dix mille personnes assistent à l'apparition nocturne de la Vierge Marie.
Le 29 juin, les voyants sont à nouveau arrêtés par la police yougoslave et emmenés à l'hôpital psychiatrique de Mostar pour y être examinés. L'examen confirme leur bon état de santé et ils sont libérés dans la soirée ; de retour sur la colline, ils assistent à une nouvelle apparition.
Le 30 juin, deux collaborateurs des services secrets convainquent les enfants de quitter Medjugorje, tandis que la colline est fermée par la police. Le soir, au moment de l'apparition, les voyants se trouvent dans une voiture entre Lubezki et Citluk et voient la Vierge venir vers eux sur la route. À cette occasion, la Vierge aurait dit qu'elle n'apparaîtrait plus que trois jours. Des doutes ont été émis quant à la véracité de l'intervention effective des services secrets dans cet événement : les enfants étaient accompagnés par deux assistantes sociales, Mica Ivankovic, cousine de Vicka et Ivanka, et Ljubica Vasilj-Gluvic. Le soir même, lors d'une conversation enregistrée avec le père Jozo, elles ont affirmé qu'elles avaient librement choisi de faire une excursion à Cerna, un lieu touristique bien connu en Bosnie, sans subir aucune pression.
Le 1er juillet, les voyants sont à nouveau emmenés par la police. L'apparition a lieu dans le fourgon de police où ils sont retenus prisonniers.
Le 2 juillet, pour échapper à la police, les garçons se cachent dans le presbytère franciscain où ils voient une nouvelle apparition de la Vierge.
À la mi-juillet, la nouvelle des apparitions présumées est publiée dans un journal catholique de Zagreb, ce qui confère aux faits une dimension internationale. Les premiers pèlerins étrangers commencent à se rendre à Medjugorje. Les autorités yougoslaves ordonnent la fermeture de Podbrdo, tandis que le 12 août, le père Jozo Zovko, chef de la communauté franciscaine de Medjugorje, est arrêté et considéré par la police comme le véritable instigateur des apparitions. Le père Jozo sera condamné à huit ans de prison pour """"atteinte à la sécurité et à l'unité de la patrie"""".
Entre-temps, Medjugorje reçoit un nombre croissant de visiteurs, de curieux et de pèlerins qui affirment voir des signes et des figures lumineuses dans le ciel. Dix-sept mois après le début des visions, le père Jozo est libéré et les autorités décident de ne plus entraver le flux des pèlerins ni les activités des voyants.